MEXCは業界最安水準の取引手数料を提供し、現物取引と先物取引のメイカー手数料は0%、テイカー手数料は0.02%である。独自トークンMXを活用すれば最大50%オフの割引が可能で、紹介コード利用でさらに10%割引が適用される。期間限定の手数料無料キャンペーンも定期的に実施され、コストを抑えながら取引が可能。手数料負けを防ぐためには、MXトークンの利用やメイカー注文の活用が推奨される。